故事发生在遥远的未来，彼时，地球已经被人类所制造的污染破坏殆尽，更有污染产生了邪恶怪兽横行占领了人类的生存空间。无奈之下，人类只能移居到了拥有独立意识的“自律型移动都市”之中，而这些都市之间，则为了争

神秘的 零号机驾驶员绫波丽，在与碇元度约定之时，来到了 底层中央教条的红色水池边。她的命运似乎就将在此结束。　　在危急时刻，葛城美里不但要完成加持良治交待的对“第二次浩劫”真相以及“人类补完

这是一个黑白颠倒欲望横行的罪恶时代，贫富差距的急剧增大直接导致了罪恶和仇恨的火种开始暗自燃烧。在六木本俱乐部中有着一个关于“女神”的传说，传说中，只要得到了女神的祝福，便能够实现所想的愿望。前战地摄影

始主魔神创造了世界，追之有了火，水，木等魔神，而魔神又创造出骨。龙之骨是地球的守护之骨。身为一个平凡高中生的龙神翔悟，突然遭到了神秘敌人“黑暗战士”的袭击，而其目的就是为了获得“骨之卡”。而后，翔悟等